Une paire d'applications Shiny permettant d'effectuer des analyses rigoureuses des voies et de l'enrichissement fonctionnel sans écrire de code. Téléversez vos résultats à l'échelle des gènes, lancez l'analyse et explorez les résultats.

Fonctionnalités

• Analyse de surreprésentation et analyse d'enrichissement par ensembles de gènes selon WikiPathways, Gene Ontology et d'autres bases de données sélectionnées, mises à jour chaque mois
• Prise en charge de multiples identifiants de gènes (Symbol, Ensembl, Entrez, UniProt) et espèces (humain et souris, extensible à d'autres)
• Graphiques interactifs : volcano plots, diagrammes en points et à barres, cartes thermiques, cartes d'enrichissement et réseaux de concepts
• Exportation au format PDF prêt pour publication, ainsi que tableaux téléchargeables en formats Excel et CSV
• Dossiers de résultats autonomes faciles à partager ou héberger, permettant aux collaborateurs et réviseurs d'explorer les données par eux-mêmes

Utilisé activement au-delà de Gladstone.

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