InPheRNo est une méthode informatique conçue pour identifier les réseaux de régulation transcriptionnelle (TRN) associés au phénotype. Contrairement à de nombreuses méthodes existantes qui reconstruisent les TRN indépendamment des propriétés phénotypiques, InPheRNo utilise un modèle graphique probabiliste pour analyser les profils d'expression génique ainsi que les scores ou étiquettes phénotypiques associés. Cela permet de cibler précisément les mécanismes de régulation directement liés à un phénotype d'intérêt, comme les mécanismes régulateurs propres à un type de cancer. L'outil peut reconstruire avec exactitude les TRN et identifier les facteurs de transcription moteurs du cancer, avec des extensions comme InPheRNo-ChIP qui intègrent des données multimodales (RNA-seq, ChIP-seq) pour une inférence encore plus précise des GRN. Il s'avère précieux pour comprendre les programmes d'expression génique dans les états sains et pathologiques, ainsi que pour identifier des cibles thérapeutiques.