Nous présentons un volume cérébral modèle standard et sans biais d'imagerie par résonance magnétique pour les données pédiatriques de la tranche d'âge de 4,5 à 18,5 ans. Ces volumes ont été créés à partir des données de 324 enfants participant à l'étude d'IRM sur le développement cérébral normal financée par les NIH (Almli et al., 2007, Evans et Group 2006). Les outils permettant d'utiliser ces atlas se trouvent dans la section Logiciels.

Méthodes

Les atlas moyens pédiatriques sont composés de :

Le prétraitement des images comprenait la correction des non-uniformités d'intensité (Sled, 1998) et la normalisation de l'intensité sur une échelle de 0 à 100. Toutes les données d'IRM pondérées en T1 ont ensuite été transformées dans l'espace stéréotaxique MNI de type Talairach à l'aide de minctracc (Collins, Neelin et al. 1994). L'extraction du cerveau a été effectuée avec BET (Smith, 2002). Des sous-groupes de sujets fondés sur l'âge ont été créés, puis toutes les acquisitions de chaque groupe ont été automatiquement réalignées sur l'espace stéréotaxique à l'aide du gabarit approprié. Pour chaque groupe, un algorithme itératif de recalage non linéaire (Grabner, Janke et al. 2006, Fonov, 2010) a été appliqué afin d'obtenir les moyennes de groupe. La transformation calculée sur le T1 a ensuite été appliquée aux volumes pondérés en T2, en DP et classifiés par tissus afin de générer les atlas moyens correspondants. Les détails méthodologiques sont décrits dans (Fonov, 2010).

Visualisation

Pour visualiser les atlas en ligne, cliquez sur le lien JIV2 correspondant dans la section Téléchargement ci-dessous.

La visualisation en ligne nécessite la prise en charge de Java dans le navigateur. Le Java Internet Viewer (JIV2) utilisé ici est disponible pour téléchargement et usage personnel sous la licence publique générale GNU (GPL).

Lors de la visualisation, les coordonnées stéréotaxiques MNI (X, Y, Z) s'affichent sur la première rangée sous les volumes. Un clic avec le bouton gauche de la souris sur n'importe quelle image permet d'actualiser les autres vues en coupe à la position correspondante. Vous pouvez également maintenir le bouton central ou la molette enfoncé tout en vous déplaçant vers le haut ou le bas pour naviguer à travers le plan de coupe. Maintenir la touche 'Maj' enfoncée avec le bouton gauche ou central active le déplacement et le zoom. Lors de l'examen des images, n'oubliez pas que la gauche est à gauche et la droite est à droite !