Vous avez une liste de gènes. Et ensuite ?

GeneSet Translator est une application Streamlit qui interroge le NCATS Biomedical Data Translator à partir de vos gènes et vous permet d'explorer en temps réel le sous-graphe de connaissances biomédicales obtenu, en regroupant plusieurs sources de données conformes à TRAPI, le regroupement de réseaux et l'expression tissulaire.

Fonctionnalités

• Requêtes multi-gènes via les API du NCATS Translator, mettant en évidence les voisinages géniques et les liens avec les maladies
• Visualisation interactive de réseaux avec Cytoscape.js
• Intégration du Human Protein Atlas pour filtrer selon le type cellulaire et l'expression tissulaire
• Résumés optionnels assistés par LLM avec citations, facilitant la formulation d'hypothèses
• Téléversement de listes de gènes personnalisées ou exemples intégrés, avec prise en charge de Docker pour un déploiement en une seule commande

Idéal pour : intégrer les listes de gènes différentiellement exprimés, les cibles GWAS ou les résultats de criblage dans un contexte biologique exploitable.

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